2014年10月22日水曜日

データベースを作る前に読んで欲しいたった10の文章


  1. 取得できていないデータの解析は出来ない
    1. 無いデータは解析できない。解析したいこと、解析したい事に関連していることは少し多目に集めておくべし。1項目足りなくてももう一回全員のカルテをめくらなくてはならない。
  2. 欠損なのか、そもそもデータがないのか、未検査だったのか
    1. あるはずのデータがないのか、男性に生理だったか聞いているのか、どう考えても元気だから検査をやらなかったのか。全く意味合いが違えば、解釈も変わってくる。
  3. 変数の名前は打ち込むときに迷わない名前に
    1. 性別を0と1でかきこんでいたとき、どちらが男性か明確に分かる人はいるだろうか(一部の男女特有の疾患は別として)
  4. カテゴリカル・データは二値に出来ないかを検討しておくこと
    1. 現場では目の前の患者さんに対して、何かをやるかやらないかの二択にいつも迫られている。そんな中、検査値を見て陽性尤度がなんたらかんたらと言っている人がいるだろうか。
  5. 一つのセルに2つ以上の情報をいれない
    1. われわれは違う情報とわかるのだが、カンピューターにはわからないのである。融通きかないのである。
  6. 数字はアラビア数字を使うこと
    1. ローマ数字を数字としてカンピュータは扱ってくれるだろうか。文字として読み取っていれば、順序の情報は消え去ってしまう。
  7. 疲れた時に打ち込むと沢山ミスをする
    1. 今日も、これからビールを飲むか、データを打ち込むかの二択を沢山の臨床家が迫られている。
  8. 子供が病気の時は打ち込んでは行けない。
    1. 家庭を崩壊してまでやる意味はあるのか。子供がそんな親を見てやりたいと思うか。
  9. 間違えないという気持ちを持つことが間違っている
    1. 完璧など存在しない。
  10. 1から9を何度か読んで、下っ端にこれみよがしに伝えて欲しい。
    1. 偉そうにしゃべるためには少なくとも自分で理解していないとダメ



まあ9.10は別としてまあまあ重要なことと思っています。
この2年半で感じていること。
FileMakerを使うことより、Accessを使うことよりずっと大事。

2014年7月10日木曜日

ロジスティック回帰を行う場合outcomeで1の時1、0のとき0となる変数を入れるとオッズを算出できない。

数学的には当たり前なんだけど、盲点。

2014年6月22日日曜日

やってもやってもおわらなくてもとにかくやる。

そしたらまた新しい疑問にぶち当たるけどとにかくやる。

そうやっていく。


2014年5月20日火曜日

多変量解析の結果の符号に納得がいかないとき

多変量解析の結果はセットで考えるべきです。

特に説明変数に相関がありそうなときは必ずです。

例えば人の命の長さとその他の臨床検査値やある地点での患者さんの状況で説明でき出来ないかと考えます。


例えば腫瘍の再発したかしていないかと腫瘍があれば異常値を表す検査があったとしてその2つで説明しようとします。


結果としてのほうではなぜかハザードが再発していたほうが-25%、検査値異常の方ではなぜか50%のハザード増加だったとしましょう。

この時疑うべきはまず変数の0と1が考えているものと逆になっていないかということ

変数のラベルが自分が思っていたのと逆になっていないかということ。

この2つを疑っても問題なしであれば、結果を信じるしかありません。

ただ、別におかしなことではないのです、

多くの場合再発していないと検査値異常は出ません。

つまり再発and異常の組み合わせや再発なしand正常にかたよることは予想できるでしょう。(検査の感度特異度にもよりますが)

このような時例えば再発すると-25%異常だと+50%なので、人の命に対するハザードは実は全体としては+25%となります。

つまり変数間の相関や関連があればあるファクターが他方のファクターを調整するような形で存在している可能性もあるかもしれないということです。

多変量解析の結果は独立して選ばれるとかそういう言葉がよく使われていますが、一般の独立という意味と少し印象が違うというか、そもそも数学的な独立、つまり基底となりうるとか線形従属とかそういう話からの独立ですので、少し難しいですよね。。。

できるだけそういうこともあるということをわかりやすく書いたつもりですが、これでもよくわからない方はお近くの統計が得意な方にヘルプを求めた方が良いと思います。

修士の時の研究でいろいろ先生に教えてもらったのを思い出しながら・・・。


2014年4月28日月曜日

土日で貯まってた仕事を片付けなくてはと思いやっていたけど、なんとなく進まなくて、積み残し多。

とりあえずあやまりの連絡を入れて、少しだけ期限を延ばしてもらう。

うーん。ダメだ。

というか今考えると自分ひとりで悩んでも解決しないことで悩み過ぎだな。

いや、それはわかってたんだけど、あれだわ、期限ギリギリでこんな質問するなんてクソにも程があるだろうとかいう謎の気持ち。

いや、聞くのが速いし、前に進まないのにね。

自分の出来ないことを棚に上げて何様だよ。ってね。

うーん。アカン。あかんー。

2014年4月26日土曜日

昨日は立川で発表を見て頂いて、いろいろとコメントを頂いた。

まだまだ感受性が低いんだな。

こういう発表をするって時はこういうことに配慮しなくてはならないとか。

そういうの。

とりあえず帰宅してバタンキュー。

今日は朝6時半位に起きたんだけど、予定が急にキャンセル。

他に色々と蹴ってこの予定入れてたので超イライラですね。

まあそういうことも有るということで、寝正月ならぬ寝土曜日。

布団から出たらもう16時で・・・。

とりあえず今日はゆっくり休んだので、また明日がんばろう。

そうしよう。

2014年4月25日金曜日

朝いちばんはじめの会議の時1つ大きな仕事を頼まれる。2つ返事してしまったが、がんばろう。

朝は資料を作ってミーティング、だったけど直前でリスケをお願いされてまたこんど。

そっから昼いちの資料作り。

昼のJCはかなり持ち上がったな。たのしい。

その後相談に答えるための解析を進めていたらもう定時。

時間が足りない。

夕方からは会議が2つ。

1つは5人ほど、1つは職場全体のモノ。

そっからは明日の東京出張の準備。抜かりなく・・・。

うーん。時間が!ない!

ちょっとなんとなく調子が悪い。

返って寝て、明日も頑張ろう。華金。